Ya en épocas del Gobernador Pedro Melo de Portugal este lugar era conocido como Paraje Isla Umbú y tenía un oratorio.
Se funda esta ciudad en 1860, por orden de Don Carlos Antonio López y dos años después comienza la construcción de la Iglesia de San Atanasio, que es uno de los valores arquitectónicos e históricos más importantes de Isla Umbú. El Mariscal López hizo una promesa y como agradecimiento lo nombró al San Atanasio como Patrono de la ciudad.
Uno de los lugares hermosos y tranquilos para visitar aquí es la Laguna Capilla, ubicada en el casco de la ciudad y que en ciertas épocas alberga una hermosa y prominente fauna de variadas aves del Ñeembucú.
Alrededor de la Iglesia existe una edificación alargada con un corredor envidiable, que fue construida para ser utilizada como Cabildo y luego en la guerra pasó a ser Cuartel del Mariscal. Hoy en día es el Museo Coronel Pedro Hermosa y guarda objetos valiosos de nuestra historia.
Isla Umbú es una ciudad muy tranquila y pequeña pero con un grandísimo potencial por estar rodeada de agua como la mayoría de las ciudades con humedales en este Departamento.
