Este museo es un trabajo dedicado del Dr. Mariano Celso Pedros, que con objetivo de salvar los ornamentos de una antigua iglesia franciscana comenzó a recolectar imágenes y piezas antiguas: reunió una enorme cantidad que hoy son el alma de esta institución clave para el legado religioso y cultural de Paraguay.
Fundado en 1964, en sus vitrinas se observan santos tallados en madera, fragmentos del altar original, cuadros de temática religiosa y mobiliario de todo tipo. También elementos bélicos protagonistas en la Guerra del Chaco y libros que pertenecieron al músico y poeta Félix Fernández.